O uso de composto é crítico para manter a saúde do solo e melhorando assim  a produção. Portanto o composto deve ser usado em combinação com fertilizante. Isto é porque, a adição de composto melhora a eficiência do uso do fertilizante, permitindo índices mais baixos que os recomendados de fertilizante caro.

Indicadores comuns de Deficiência

Nitrogênio (N): As folhas têm uma aparência de verde leve amarelado, folhas especialmente mais velhas; crescimento retardado; desenvolvimento pobre da fruta.

Fósforo (P): As folhas podem desenvolver coloração roxa; crescimento da planta é retardado  e atrofia o desenvolvimento da planta.

Potássio (K): As folhas mais velhas tornam-se amarelas inicialmente ao redor das margens e morrem;  há desenvolvimento irregular da fruta.

Cálcio (Ca): Crescimento reduzido ou morte das gemas terminais apodrecimento da ponta das flores do tomateiro; pobre desenvolvimento da fruta e desagradável aparência da mesma.

Magnésio (Mg): Inicial amarelecimento das folhas mais velhas, entre as nervuras,  espalhando-se as folhas mais jovens;  pobre desenvolvimento da fruta e produção baixa.

Enxofre (S): Inicial amarelecimento de folhas jovens espalhando-se a planta inteira; sintomas semelhantes aos da deficiência de nitrogênio, mas ocorre em novas plantas.

Ferro (Fe): amarelo distinto Inicial ou áreas brancas entre nervuras de folhas jovens levam ao surgimento de manchas de tecido morto da folha.

 Manganês/ Manganêsio (Mn): Amarelecimento internervural ou salpicamento de pintas de folhas jovens.

Zinco(Zn): Amarelecimento internervural em folhas jovens;  tamanho reduzido da folha.

Boro(B): Morte de gemas terminais e deformação de folhas com áreas de discoloração.